Bioptimusの7,600万ドルの賭け：生物学全体のための単一基盤モデル、まずオープンに

パリを拠点とするスタートアップで、病理スライド、ゲノミクス、臨床記録といったマルチモーダルな生物学的データで大規模AI基盤モデルを訓練し、診断と創薬を加速する。製薬企業や研究者にモデルへのアクセスを販売している。

生物学が次の基盤モデル領域になるという賭け：病院の患者データで訓練された単一のマルチモーダルモデルが、疾患をシミュレーションし、転帰を予測し、創薬を加速しうるというもの。

3,500万ドルのシード（2024年2月、Sofinnova Partnersが主導、Bpifrance、Cathay Innovation、Xavier Niel、Owkinが参加）、続いて4,100万ドルのシリーズA（2025年1月、Cathay Innovationが主導）— 合計7,600万ドル。

Bioptimusは2024年2月20日、パリでフランスのバイオテック・ユニコーンであるOwkinのスピンオフとしてステルスから登場した。Owkinの最高R&D責任者Jean-Philippe Vertと、CTOのRodolphe Jenattonを含む元GoogleおよびDeepMindの研究者らによって共同創業された。Sofinnova Partnersが主導する3,500万ドルのシードを調達し、AWSとのコンピュート提携を締結し、主要な学術病院からのOwkinのマルチモーダル患者データを用いて生物学の基盤モデルを訓練することを目指した。

2024年7月、ローンチから5か月足らずで、BioptimusはH-Optimus-0をリリースした。これは世界最大のオープンソース病理基盤モデルであり、50万枚以上の組織病理スライドで訓練された11億パラメータのモデルで、がん細胞の検出から腫瘍バイオマーカーまで、診断タスクで最先端の結果を達成したと主張した。2025年1月にはCathay Innovationが主導する4,100万ドルのシリーズAを調達し（Sofinnova、Bpifrance、Andera、Hitachi Ventures、Boom Capital、Pomifer、Sunriseおよびエンジェル投資家らが参加）、総調達額は7,600万ドルに達した。そして生物学の全スペクトラムにわたるマルチモーダルモデルを準備していると述べた。

生物学がテキストや画像に続き、1つの大きなモデルが多くの小さなモデルに勝る領域になるという賭け——「生物学のGPT」。

Owkinが蓄積した病院データが堀であった。機微な臨床データは公開されていないため、競合他社は訓練データセットを容易に複製できなかった。

H-Optimus-0を先にオープンソース化したことで科学的信頼性と採用が築かれ、商業展開の前に研究者をユーザーに転換した。

Owkinからのスピンオフは理にかなっていた。基盤モデルには独自の資本、コンピュート、データ戦略が必要であり、「ピュアプレイヤー」の方が速く動けたからだ。

独占的なマルチモーダルデータは堀になりうる。Owkinの病院ネットワークにより、シード段階のスタートアップが競合にできないモデルを訓練でき、最初のモデルをオープンソース化することで商業提案の前に信頼性を築いた。

2026年8月時点で、Bioptimusは非公開のままで、調達額は7,600万ドル、これ以上のラウンドは公に報告されていない。同社のウェブサイトによれば、そのモデルはトップ20の製薬企業のうち16社と1,000以上の機関に信頼されており、モデルの総ダウンロード数は1,184,533件、同社モデルを用いた論文は100本以上発表されている。同社は病理という足がかりを超え、組織学、空間トランスクリプトミクス、ゲノミクスを1つのアーキテクチャに統合するM-Optimusへと進み、地理をまたいで深くプロファイリングされ臨床的に紐付けられた患者データを生成する多機関データエンジンSTELAを立ち上げた。